Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms