Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms