Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Pramef8Q8CE24 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef8Q8CE24 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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