Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Htatsf1Q8BGC0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms