Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms