Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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