Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms