Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms