Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms