Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr1bP70700 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms