Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms