Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ptk2P34152 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ptk2P34152 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ptk2P34152 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ptk2P34152 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptk2P34152 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms