Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pabpc1P29341 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pabpc1P29341 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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