Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RxraP28700 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms