Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms