Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm6498-201ENSMUST00000181413 1006 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Csf1r-201ENSMUST00000025523 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms