Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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