Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csnk2a2O54833 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms