Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms