Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms