Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms