Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rabgef1Q9JM13 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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