Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms