Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rfc5Q9D0F6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rfc5Q9D0F6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rfc5Q9D0F6 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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