Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms