Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.9 ms