Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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