Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Supt6hQ62383 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Supt6hQ62383 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms