Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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