Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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