Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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