Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm17577J3QNF7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm17577J3QNF7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm17577J3QNF7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm17577J3QNF7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm17577J3QNF7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm17577J3QNF7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm17577J3QNF7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms