Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms