Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn2r40F6W043 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms