Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf169E9Q7F2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rnf169E9Q7F2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf169E9Q7F2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rnf169E9Q7F2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf169E9Q7F2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf169E9Q7F2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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