Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms