Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms