Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Higd1aQ9JLR9 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms