Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms