Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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