Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D1F3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms