Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms