Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms