Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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