Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms