Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms