Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp54Q8BL06 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms