Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm29272-201ENSMUST00000185476 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21829-201ENSMUST00000188787 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21892-201ENSMUST00000189182 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28247-201ENSMUST00000189329 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28350-201ENSMUST00000189453 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21906-201ENSMUST00000189760 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm29411-201ENSMUST00000189889 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21717-201ENSMUST00000189902 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21765-201ENSMUST00000189913 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21895-201ENSMUST00000189997 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21734-201ENSMUST00000190346 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21902-201ENSMUST00000190361 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm29029-201ENSMUST00000190520 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21898-201ENSMUST00000190727 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm29300-201ENSMUST00000190738 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20793-201ENSMUST00000190779 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm28879-201ENSMUST00000190973 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
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