Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms