Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms